Кандидат биологических наук, до 2003 года Екатерина Чистякова была научным сотрудником Института биологии развития РАН. Потом в качестве специалиста по связям с общественностью работала в медицинской лабораторной компании "Аналитика".

С 2003 года – один из создателей инициативной волонтерской группы "Доноры – детям" и, позже, фонда "Подари жизнь". Волонтеры группы "Доноры - детям" занимаются привлечением доноров крови для детей с онкогематологическими заболеваниями, а фонд- поиском средств на их лечение, организацией быта и досуга больных детей и пропагандой донорства крови.

Принимала участие в создании программы модернизации Службы крови России и в разработке законов "О донорстве крови и ее компонентов", в создании ряда статей законов "Об основах охраны здоровья граждан в Российской Федерации", "Об обращении лекарственных средств" в части создания законодательных основ оказания паллиативной помощи, обращения орфанных лекарственных препаратов и ввоза незарегистрированных лекарств в для индивидуального применения.

В рамках работы в Совете при Правительстве РФ по вопросам попечительства в социальной сфере была инициатором и одним из разработчиков Дорожной карты по повышению доступности обезболивающих препаратов.